Gazdag ismeretszerzési, felfedezési élményt kínál a JPM Természettörténeti Múzeuma. Megtekinthető itt az ország harmadik legnagyobb madártojásgyűjteménye, a Pannon-tenger mocsaras partjain élő mecseki dinoszaurusz nyomai éppúgy, mint a jégkorszaki ősmaradványok között a „pécsi mammut” csontjai. Évek óta népszerűnek bizonyulnak a múzeum rendszeresen megtartott múzeumpedagógiai foglalkozásai, kirándulásai, időszakos kiállításai, nyári táborai.